20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0441 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0441  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  333  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.688781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04040  hypothetical protein  24.64 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2949  hypothetical protein  25.95 
 
 		 216 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.631549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1296  hypothetical protein  24.39 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0368  hypothetical protein  25.6 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0111  hypothetical protein  23.49 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0479714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1659  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1193  hypothetical protein  22.76 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0917  hypothetical protein  24.22 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.874284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4276  hypothetical protein  21.21 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2686  hypothetical protein  22.83 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.532977  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1025  hypothetical protein  22.05 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2907  conserved hypothetical protein DUF1285  22.13 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0794493  normal  0.601821 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0283  hypothetical protein  26.61 
 
 		 216 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2235  hypothetical protein  23.62 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0787  protein of unknown function DUF1285  27.27 
 
 		 242 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.138804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3250  hypothetical protein  23.97 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0202  hypothetical protein  20.66 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.483999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2845  hypothetical protein  22.56 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.510951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4145  hypothetical protein  21.85 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>