18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4853 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4853  metallophosphoesterase  100 
 
 		 430 aa  885    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3092  hypothetical protein  58.63 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.932849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  29.02 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  26.79 
 
 		 683 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  27.25 
 
 		 890 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4590  putative modular protein  26.98 
 
 		 702 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  26.91 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  26.05 
 
 		 492 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  27.3 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2692  secreted protein  27.33 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  25 
 
 		 2105 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3300  putative secreted protein  26.5 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22750  Calcineurin-like phosphoesterase  25.68 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.623762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1616  cell wall anchor domain-containing protein  27.21 
 
 		 757 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0744  metallophosphoesterase  22.96 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.110446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.33 
 
 		 2668 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  24.5 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  24.86 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>