25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1284 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  100 
 
 
506 aa  1051    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  39.12 
 
 
649 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  33.52 
 
 
489 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  28.44 
 
 
890 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  33.02 
 
 
492 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0744  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.110446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  25.74 
 
 
683 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  26.27 
 
 
357 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2692  secreted protein  27.11 
 
 
574 aa  93.6  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.23 
 
 
2668 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3300  putative secreted protein  25.09 
 
 
662 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22750  Calcineurin-like phosphoesterase  26.82 
 
 
626 aa  83.6  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.623762  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3227  Hyaluronate lyase  34.91 
 
 
1131 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.14 
 
 
748 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4590  putative modular protein  23.49 
 
 
702 aa  76.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1616  cell wall anchor domain-containing protein  26.12 
 
 
757 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551257  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  24.65 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.39 
 
 
1657 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
2105 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2608  hypothetical protein  34.07 
 
 
238 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4853  metallophosphoesterase  24.86 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0444  YvnB  53.85 
 
 
98 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3092  hypothetical protein  21.57 
 
 
447 aa  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.932849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1293  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.72 
 
 
1009 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00882728  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.87 
 
 
1246 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>