17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3092 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3092  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  905    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.932849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4853  metallophosphoesterase  57.49 
 
 		 430 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  28.06 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 890 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  26.9 
 
 		 683 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  24.86 
 
 		 489 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1616  cell wall anchor domain-containing protein  27.11 
 
 		 757 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4590  putative modular protein  28.57 
 
 		 702 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3300  putative secreted protein  26.72 
 
 		 662 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  24.86 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  26.51 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22750  Calcineurin-like phosphoesterase  26.52 
 
 		 626 aa  73.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.623762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0744  metallophosphoesterase  27.02 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.110446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  24.92 
 
 		 2105 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2692  secreted protein  25.58 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  21.85 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.05 
 
 		 2668 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>