60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3956 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3956  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2014  cell division protein MraZ  28.48 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3179  cell division protein MraZ  30.5 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.890567  normal  0.833731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0959  MraZ protein  34.87 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0054  cell division protein MraZ  33.81 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0679  cell division protein MraZ  28.17 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2412  hypothetical protein  33.56 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1853  hypothetical protein  29.61 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2087  hypothetical protein  28.76 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0943454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1328  cell division protein MraZ  23.84 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293135  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0944  cell division protein MraZ  26.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0974  cell division protein MraZ  26.03 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1992  cell division protein MraZ  23.97 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.085439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2475  cell division protein MraZ  29.27 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.459298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2770  MraZ, putative  30.94 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13160  cell division protein MraZ  23.7 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0204  cell division protein MraZ  24.11 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4521  cell division protein MraZ  22.81 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.865162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0682  cell division protein MraZ  26.29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4396  cell division protein MraZ  22.81 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4682  cell division protein MraZ  24.42 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1124  hypothetical protein  32.33 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2749  mraZ-like  25.16 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0935  cell division protein MraZ  22.88 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0582  cell division protein MraZ  27.61 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110988  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0771  cell division protein MraZ  26.39 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0203669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2095  cell division protein MraZ  26.39 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2870  hypothetical protein  21.69 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1561  cell division protein MraZ  29.71 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3476  protein of unknown function UPF0040  28.29 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0683  hypothetical protein  31.65 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2091  cell division protein MraZ  27.4 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0247737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1256  MraZ protein  23.78 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00006423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3777  MraZ protein  24.09 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  unclonable  0.00000602512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1104  MraZ protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000730324  normal  0.996459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2623  MraZ protein  25.15 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  unclonable  0.0000000000051755 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2615  MraZ protein  24.03 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0737  MraZ protein  23.45 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0135591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2016  cell division protein MraZ  28 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1562  cell division protein MraZ  28.99 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4993  cell division protein MraZ  22.67 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0441  MraZ protein  24.09 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0913  cell division protein MraZ  22.88 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3078  cell division protein MraZ  25.85 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2018  cell division protein MraZ  23.84 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1652  MraZ protein  27.59 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2503  cell division protein MraZ  27.01 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0839  cell division protein MraZ  25 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2104  protein of unknown function UPF0040  27.7 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470462  hitchhiker  0.006956 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2210  MraZ protein  23.49 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.703497  normal  0.199603 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0428  MraZ protein  36.54 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.452163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57460  cell division protein MraZ  22.09 
 
 		 151 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1033  cell division protein MraZ  26.11 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0558  hypothetical protein  23.65 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3298  cell division protein MraZ  24.83 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0387  cell division protein MraZ  27.69 
 
 		 132 aa  41.2  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0668298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2278  cell division protein MraZ  27.1 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0319  MraZ protein  24.03 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3676  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2899  cell division protein MraZ  29.5 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>