13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1124 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1124  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1890  hypothetical protein  35.61 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.999543  normal  0.0939897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3179  cell division protein MraZ  30.23 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.890567  normal  0.833731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3956  hypothetical protein  32.33 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2615  MraZ protein  26.67 
 
 
151 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2412  hypothetical protein  32.58 
 
 
161 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706299  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0558  hypothetical protein  27.97 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0959  MraZ protein  31.62 
 
 
155 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0054  cell division protein MraZ  27.86 
 
 
173 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3676  hypothetical protein  29.06 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3777  MraZ protein  26.72 
 
 
143 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  unclonable  0.00000602512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2623  MraZ protein  26.23 
 
 
151 aa  41.6  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  unclonable  0.0000000000051755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6970  MraZ protein  25.36 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.0405761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>