256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2412 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2412  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  323  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706299  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3476  protein of unknown function UPF0040  43.42 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0683  hypothetical protein  45.27 
 
 
164 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1853  hypothetical protein  42.57 
 
 
157 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884765  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3179  cell division protein MraZ  42.52 
 
 
158 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.890567  normal  0.833731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2087  hypothetical protein  39.85 
 
 
165 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0943454  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2091  cell division protein MraZ  37.32 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0247737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2899  cell division protein MraZ  37.32 
 
 
146 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0054  cell division protein MraZ  41.6 
 
 
173 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2016  cell division protein MraZ  34.62 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3676  hypothetical protein  37.01 
 
 
169 aa  87.4  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2603  cell division protein MraZ  36.15 
 
 
145 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0270892  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0959  MraZ protein  41.48 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2863  cell division protein MraZ  36.15 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0582  cell division protein MraZ  34.03 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110988  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2475  cell division protein MraZ  36.57 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.459298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1617  MraZ protein  31.54 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0752  cell division protein MraZ  32 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2014  cell division protein MraZ  33.8 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3777  MraZ protein  33.08 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  unclonable  0.00000602512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1045  MraZ protein  31.16 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0627  cell division protein MraZ  31.2 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0601  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22890  mraZ protein  36.42 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544234  normal  0.034348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2503  cell division protein MraZ  33.88 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2843  MraZ protein  28 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0639  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1104  MraZ protein  33.85 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000730324  normal  0.996459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1275  MraZ protein  33.82 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185799  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0913  cell division protein MraZ  30.94 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361381  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13160  cell division protein MraZ  31.13 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1295  MraZ protein  30.94 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09000  MraZ protein  28.06 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2709  MraZ protein  29.79 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0155506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0817  hypothetical protein  32.37 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1197  cell division protein MraZ  28.97 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000030245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0136  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0128  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0131  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.604407  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0131  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0135  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185871 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1992  cell division protein MraZ  30.83 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.085439  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0204  cell division protein MraZ  30.83 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00082  hypothetical protein  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0083  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.838151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0087  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3576  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.817951  hitchhiker  0.000645045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0074  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0089  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.818798 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0086  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.471312  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00081  hypothetical protein  30.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3519  MraZ protein  30.4 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2437  cell division protein MraZ  31.4 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4417  marZ family protein  30.37 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026637  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl395  cell division protein MraZ  25.87 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000155382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4111  cell division protein MraZ  30.37 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00625332  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1562  cell division protein MraZ  36.96 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1461  cell division protein MraZ  31.69 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0394  MraZ protein  32.06 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.162615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0215  mraZ protein  32.06 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4072  cell division protein MraZ  32.37 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2480  MraZ protein  32 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3601  cell division protein MraZ  28.8 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1210  cell division protein MraZ  30.26 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.192448  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3789  cell division protein MraZ  28.8 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0982  cell division protein MraZ  32.84 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.504694  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2927  cell division protein MraZ  29.6 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13690  cell division protein MraZ  35.51 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4474  cell division protein MraZ  26.47 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3527  cell division protein MraZ  29.6 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3396  cell division protein MraZ  29.6 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0887  MraZ protein  33.33 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0428  MraZ protein  27.4 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.452163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1587  MraZ protein  36.23 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1066  cell division protein MraZ  29.63 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1561  cell division protein MraZ  36.23 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2018  cell division protein MraZ  29.55 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0558  hypothetical protein  29.92 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1065  MraZ protein  35.46 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208213  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0475  cell division protein MraZ  33.83 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000349063  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1501  cell division protein MraZ  29.55 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0584  cell division protein MraZ  32.12 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1268  MraZ protein  27.34 
 
 
143 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2623  MraZ protein  29.2 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  unclonable  0.0000000000051755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3072  MraZ protein  33.57 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0158  cell division protein MraZ  31.25 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0732  cell division protein MraZ  29.77 
 
 
149 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0629186  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0666  cell division protein MraZ  30.22 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1328  cell division protein MraZ  28.06 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293135  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4228  cell division protein MraZ  27.03 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0974  cell division protein MraZ  29.17 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0110  hypothetical protein  30.3 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4521  cell division protein MraZ  28.06 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.865162  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3528  cell division protein MraZ  30.4 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0349  cell division protein MraZ  30 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4396  cell division protein MraZ  28.06 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0935  cell division protein MraZ  28.06 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4561  cell division protein MraZ  28.47 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2100  cell division protein MraZ  29.6 
 
 
152 aa  62.4  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.713694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3208  cell division protein MraZ  34.78 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000170601  normal  0.0171903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>