234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3476 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3476  protein of unknown function UPF0040  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0683  hypothetical protein  80.49 
 
 
164 aa  275  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1853  hypothetical protein  58.55 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884765  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2412  hypothetical protein  43.42 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706299  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2087  hypothetical protein  41.55 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0943454  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2016  cell division protein MraZ  41.06 
 
 
156 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2091  cell division protein MraZ  40.41 
 
 
146 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0247737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2899  cell division protein MraZ  37.5 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2603  cell division protein MraZ  36.89 
 
 
145 aa  94  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0270892  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0054  cell division protein MraZ  39.2 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2863  cell division protein MraZ  35.25 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3676  hypothetical protein  35.77 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3179  cell division protein MraZ  37.8 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.890567  normal  0.833731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2902  cell division protein MraZ  32.43 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0748226  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0788  MraZ protein  29.23 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0959  MraZ protein  36.11 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2475  cell division protein MraZ  30.43 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.459298 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0964  cell division protein MraZ  34.45 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114195 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2511  cell division protein MraZ  31.37 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2119  cell division protein MraZ  29.66 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2014  cell division protein MraZ  31.71 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2503  cell division protein MraZ  28.8 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0204  cell division protein MraZ  30.63 
 
 
152 aa  60.8  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1992  cell division protein MraZ  30.63 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.085439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0345  cell division protein MraZ  27.34 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.296639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0732  cell division protein MraZ  31.36 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0629186  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0627  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2749  mraZ-like  25.93 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2615  MraZ protein  28.47 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0349  cell division protein MraZ  26.02 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0582  cell division protein MraZ  29.32 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110988  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0974  cell division protein MraZ  27.05 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0944  cell division protein MraZ  27.05 
 
 
152 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16650  mraZ protein  28.47 
 
 
143 aa  57.8  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.103702  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0752  cell division protein MraZ  30.09 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2278  cell division protein MraZ  27.34 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0346  cell division protein MraZ  25.58 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3520  MraZ protein  29.45 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2709  MraZ protein  28.35 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0155506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0601  cell division protein MraZ  28.57 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4474  cell division protein MraZ  23.36 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0110  hypothetical protein  28.03 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0639  cell division protein MraZ  26.09 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6970  MraZ protein  23.48 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2770  MraZ, putative  28.19 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.80175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3813  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1617  MraZ protein  27.33 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3462  cell division protein MraZ  27.13 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.135005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3528  cell division protein MraZ  28.46 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2480  MraZ protein  27.27 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0913  cell division protein MraZ  30.58 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361381  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5775  MraZ protein  28.87 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0215  mraZ protein  29.69 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0394  MraZ protein  29.69 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.162615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24980  mraZ protein  30.88 
 
 
143 aa  55.5  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00082  hypothetical protein  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3576  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.817951  hitchhiker  0.000645045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0083  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.838151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0087  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3820  cell division protein MraZ  25.6 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0089  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.818798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0817  hypothetical protein  24.67 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0086  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.471312  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00081  hypothetical protein  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0074  cell division protein MraZ  26.83 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2095  cell division protein MraZ  27.41 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0771  cell division protein MraZ  27.41 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0203669  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0682  cell division protein MraZ  28.99 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  0.159895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3519  MraZ protein  26.83 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0128  cell division protein MraZ  26.02 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0839  cell division protein MraZ  32.14 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0136  cell division protein MraZ  26.02 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1268  MraZ protein  27.03 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1275  MraZ protein  27.08 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0737  MraZ protein  26.92 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0135591  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1208  MraZ protein  21.99 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0131  cell division protein MraZ  26.02 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.604407  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0131  cell division protein MraZ  26.02 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0135  cell division protein MraZ  26.02 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185871 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1197  cell division protein MraZ  23.7 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000030245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3789  cell division protein MraZ  27.43 
 
 
152 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4228  cell division protein MraZ  24.81 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4111  cell division protein MraZ  34.19 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00625332  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1984  MraZ protein  23.08 
 
 
143 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57460  cell division protein MraZ  31.06 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1587  MraZ protein  29.41 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4993  cell division protein MraZ  31.06 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2623  MraZ protein  27.82 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.883796  unclonable  0.0000000000051755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2210  MraZ protein  27.14 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.703497  normal  0.199603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1065  MraZ protein  27.94 
 
 
150 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208213  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4417  marZ family protein  28.23 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4396  cell division protein MraZ  27.91 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2202  cell division protein MraZ  30.14 
 
 
150 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.652651  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1210  cell division protein MraZ  25.85 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.192448  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0935  cell division protein MraZ  27.91 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3462  MraZ protein  28.69 
 
 
150 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4521  cell division protein MraZ  27.91 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.865162  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3601  cell division protein MraZ  27.43 
 
 
152 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3527  cell division protein MraZ  24.64 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3396  cell division protein MraZ  24.64 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>