197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2091 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2091  cell division protein MraZ  100 
 
 
146 aa  298  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0247737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2899  cell division protein MraZ  71.53 
 
 
146 aa  219  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2863  cell division protein MraZ  74.48 
 
 
175 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2603  cell division protein MraZ  73.79 
 
 
145 aa  206  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0270892  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2016  cell division protein MraZ  53.62 
 
 
156 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0683  hypothetical protein  42.47 
 
 
164 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.184065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1853  hypothetical protein  38 
 
 
157 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.884765  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3476  protein of unknown function UPF0040  40.41 
 
 
164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2412  hypothetical protein  37.32 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.706299  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2087  hypothetical protein  34.29 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0943454  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0054  cell division protein MraZ  34.4 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3179  cell division protein MraZ  32.89 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.890567  normal  0.833731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3676  hypothetical protein  34.33 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0959  MraZ protein  33.11 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0752  cell division protein MraZ  25.86 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0601  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.843226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0639  cell division protein MraZ  25.41 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3519  MraZ protein  24.59 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0910  cell division protein MraZ  30.53 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2927  cell division protein MraZ  25 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3789  cell division protein MraZ  24.14 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0128  cell division protein MraZ  24.14 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0136  cell division protein MraZ  24.14 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0627  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.657615  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0135  cell division protein MraZ  24.14 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3527  cell division protein MraZ  25 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0131  cell division protein MraZ  24.14 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.604407  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0131  cell division protein MraZ  24.14 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3396  cell division protein MraZ  25 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00082  hypothetical protein  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0086  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.471312  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0558  hypothetical protein  22.95 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701365  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3576  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.817951  hitchhiker  0.000645045 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00081  hypothetical protein  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0074  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0089  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.818798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0087  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0083  cell division protein MraZ  24.59 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.838151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0760  cell division protein MraZ  27.56 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.776691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0935  cell division protein MraZ  26.72 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4521  cell division protein MraZ  26.72 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.865162  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4396  cell division protein MraZ  26.72 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1104  MraZ protein  27.2 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000730324  normal  0.996459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1328  cell division protein MraZ  26.72 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293135  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2202  cell division protein MraZ  25.17 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.652651  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3601  cell division protein MraZ  23.28 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0582  cell division protein MraZ  27.34 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110988  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0812  cell division protein MraZ  31.3 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.49655  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3777  MraZ protein  27.64 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  unclonable  0.00000602512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0839  cell division protein MraZ  29.71 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4561  cell division protein MraZ  30.83 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4993  cell division protein MraZ  28.46 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3874  hypothetical protein  29.01 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4111  cell division protein MraZ  27.59 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00625332  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4682  cell division protein MraZ  26.72 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57460  cell division protein MraZ  28.46 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0204  cell division protein MraZ  26.05 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1992  cell division protein MraZ  26.05 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.085439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3434  cell division protein MraZ  28.95 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2870  hypothetical protein  25.56 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2278  cell division protein MraZ  29.13 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0913  cell division protein MraZ  29.27 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361381  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0974  cell division protein MraZ  24.83 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0944  cell division protein MraZ  24.83 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2461  cell division protein MraZ  25.55 
 
 
150 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4417  marZ family protein  26.72 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3817  protein of unknown function UPF0040  28 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0964  cell division protein MraZ  31.62 
 
 
149 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3761  hypothetical protein  28 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.568971  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1066  cell division protein MraZ  25.95 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2989  cell division protein MraZ  28.24 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1256  MraZ protein  23.85 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00006423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3679  cell division protein MraZ  28.24 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.954667  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3901  protein of unknown function UPF0040  28 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13160  cell division protein MraZ  25.76 
 
 
152 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2104  protein of unknown function UPF0040  29.63 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.470462  hitchhiker  0.006956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2437  cell division protein MraZ  23.02 
 
 
152 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0863  MraZ protein  26.83 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0172  hypothetical protein  26.28 
 
 
173 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.438728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2503  cell division protein MraZ  23.93 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.56039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2014  cell division protein MraZ  23.78 
 
 
167 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2480  MraZ protein  29.51 
 
 
141 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1617  MraZ protein  24.46 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1208  MraZ protein  27.34 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0788  MraZ protein  22.58 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3426  cell division protein MraZ  25.95 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179615  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2709  MraZ protein  26.67 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0155506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3528  cell division protein MraZ  23.21 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2210  MraZ protein  22.76 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.703497  normal  0.199603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0732  cell division protein MraZ  29.41 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0629186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0215  mraZ protein  27.73 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2100  cell division protein MraZ  23.77 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.713694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0394  MraZ protein  27.73 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.162615 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08770  hypothetical protein  25.83 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000078217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0887  MraZ protein  24.26 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3479  cell division protein MraZ  27.27 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000276815  normal  0.0106308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1295  MraZ protein  26.67 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0477  cell division protein MraZ  28.36 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546834  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0401  cell division protein MraZ  22.4 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0679  cell division protein MraZ  29.2 
 
 
159 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>