55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24280  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1513  hypothetical protein  86.27 
 
 		 99 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2178  hypothetical protein  76.47 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847853  hitchhiker  0.00166357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2235  hypothetical protein  76.47 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2189  hypothetical protein  76.47 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.81414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2465  hypothetical protein  75.49 
 
 		 100 aa  159  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3935  hypothetical protein  74.51 
 
 		 100 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465243  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3761  hypothetical protein  75.49 
 
 		 99 aa  157  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0166543  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1882  hypothetical protein  74.51 
 
 		 99 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12714  hypothetical protein  72.55 
 
 		 100 aa  151  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2249  hypothetical protein  69.61 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1935  hypothetical protein  68.63 
 
 		 99 aa  140  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0431049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16100  hypothetical protein  67.65 
 
 		 99 aa  138  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.360035  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1869  hypothetical protein  69.61 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4534  hypothetical protein  68.63 
 
 		 99 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167065  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15800  hypothetical protein  65.69 
 
 		 98 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.147759  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1443  hypothetical protein  68.32 
 
 		 98 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134283  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1478  hypothetical protein  66.67 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0814389  normal  0.972337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1939  hypothetical protein  62.75 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.965049  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1924  hypothetical protein  62.75 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0297507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1701  hypothetical protein  64.71 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00523929  normal  0.166076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6771  hypothetical protein  61.76 
 
 		 99 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1411  hypothetical protein  63.73 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.594815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1555  hypothetical protein  64.71 
 
 		 99 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2883  hypothetical protein  60.78 
 
 		 98 aa  130  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2296  hypothetical protein  60.78 
 
 		 99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672941  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1404  hypothetical protein  62.75 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1634  hypothetical protein  61.39 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156977  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1697  hypothetical protein  61.76 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1633  hypothetical protein  59.8 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2911  hypothetical protein  62.75 
 
 		 96 aa  120  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0756  hypothetical protein  60.78 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4596  hypothetical protein  59.43 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4064  hypothetical protein  59.43 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470832  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0875  hypothetical protein  58.82 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13140  hypothetical protein  62.38 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0412244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0365  hypothetical protein  57.84 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0375  hypothetical protein  57.84 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0354  hypothetical protein  57.84 
 
 		 97 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3581  hypothetical protein  55.45 
 
 		 99 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14480  hypothetical protein  55.88 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350953  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0458  hypothetical protein  55.45 
 
 		 99 aa  104  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0702  hypothetical protein  51.46 
 
 		 97 aa  98.2  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0306  hypothetical protein  50.49 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000000713456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1354  hypothetical protein  53.92 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5163  hypothetical protein  52.94 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  0.0122988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1758  hypothetical protein  49.02 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182199 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4597  hypothetical protein  47.06 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0167  hypothetical protein  48.04 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5620  hypothetical protein  47.12 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00532761  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0922  hypothetical protein  46.15 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4179  hypothetical protein  44.12 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0240  hypothetical protein  43.14 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1898  hypothetical protein  40.2 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4437  hypothetical protein  41.18 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>