55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2249 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2249  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  200  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2178  hypothetical protein  84.85 
 
 
119 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847853  hitchhiker  0.00166357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2189  hypothetical protein  84.85 
 
 
119 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.81414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2235  hypothetical protein  84.85 
 
 
119 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685759  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3935  hypothetical protein  84.85 
 
 
100 aa  174  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465243  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1882  hypothetical protein  82.83 
 
 
99 aa  173  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2465  hypothetical protein  83.84 
 
 
100 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.440907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12714  hypothetical protein  81.82 
 
 
100 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392974  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3761  hypothetical protein  78.79 
 
 
99 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0166543  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1513  hypothetical protein  71.72 
 
 
99 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1869  hypothetical protein  71.72 
 
 
100 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16100  hypothetical protein  73.74 
 
 
99 aa  147  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.360035  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1935  hypothetical protein  71.72 
 
 
99 aa  147  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0431049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1411  hypothetical protein  71.72 
 
 
98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.594815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24280  hypothetical protein  69.61 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1633  hypothetical protein  71.72 
 
 
97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1701  hypothetical protein  70.71 
 
 
99 aa  143  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00523929  normal  0.166076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1924  hypothetical protein  66.67 
 
 
99 aa  140  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0297507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6771  hypothetical protein  66.67 
 
 
99 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1634  hypothetical protein  69.39 
 
 
99 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156977  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1555  hypothetical protein  68.69 
 
 
99 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4534  hypothetical protein  66.67 
 
 
99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167065  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1404  hypothetical protein  66.67 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1443  hypothetical protein  68.37 
 
 
98 aa  137  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134283  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2883  hypothetical protein  61.62 
 
 
98 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15800  hypothetical protein  64.65 
 
 
98 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.147759  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1478  hypothetical protein  66.67 
 
 
98 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0814389  normal  0.972337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1939  hypothetical protein  63.64 
 
 
99 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.965049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2296  hypothetical protein  64.65 
 
 
99 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672941  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4596  hypothetical protein  66.99 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0365  hypothetical protein  63.64 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0354  hypothetical protein  63.64 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113616  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0375  hypothetical protein  63.64 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4064  hypothetical protein  65.05 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470832  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2911  hypothetical protein  66.67 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0756  hypothetical protein  64.65 
 
 
100 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3581  hypothetical protein  64.29 
 
 
99 aa  123  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14480  hypothetical protein  61.62 
 
 
100 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350953  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13140  hypothetical protein  67.35 
 
 
99 aa  120  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0412244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0458  hypothetical protein  62.24 
 
 
99 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1697  hypothetical protein  58.59 
 
 
98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0875  hypothetical protein  60.61 
 
 
100 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0702  hypothetical protein  51 
 
 
97 aa  94.7  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1354  hypothetical protein  59.6 
 
 
97 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5163  hypothetical protein  56.57 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  0.0122988 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0306  hypothetical protein  51.49 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000000713456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5620  hypothetical protein  52.43 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00532761  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0922  hypothetical protein  52.43 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4179  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0240  hypothetical protein  46.46 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1898  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1758  hypothetical protein  47.47 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0167  hypothetical protein  45.45 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4597  hypothetical protein  46.46 
 
 
100 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4437  hypothetical protein  45.45 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>