55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1555 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1555  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  202  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16100  hypothetical protein  79.8 
 
 		 99 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.360035  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1924  hypothetical protein  76.77 
 
 		 99 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0297507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1935  hypothetical protein  77.78 
 
 		 99 aa  161  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0431049 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4064  hypothetical protein  79.61 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470832  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1701  hypothetical protein  74.75 
 
 		 99 aa  154  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00523929  normal  0.166076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1411  hypothetical protein  75.51 
 
 		 98 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.594815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15800  hypothetical protein  75.51 
 
 		 98 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.147759  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4596  hypothetical protein  74.51 
 
 		 103 aa  150  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6771  hypothetical protein  71.72 
 
 		 99 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1634  hypothetical protein  71.13 
 
 		 99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156977  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1939  hypothetical protein  70.41 
 
 		 99 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.965049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2883  hypothetical protein  67.35 
 
 		 98 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2911  hypothetical protein  73.47 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1633  hypothetical protein  72.45 
 
 		 97 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2235  hypothetical protein  68 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2296  hypothetical protein  67.68 
 
 		 99 aa  140  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672941  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2189  hypothetical protein  68 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.81414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2178  hypothetical protein  68 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847853  hitchhiker  0.00166357 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1404  hypothetical protein  69.7 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4534  hypothetical protein  67.68 
 
 		 99 aa  140  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167065  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3935  hypothetical protein  67 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465243  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2465  hypothetical protein  67 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12714  hypothetical protein  66 
 
 		 100 aa  137  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2249  hypothetical protein  68.69 
 
 		 99 aa  138  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1882  hypothetical protein  68.69 
 
 		 99 aa  136  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1478  hypothetical protein  67.35 
 
 		 98 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0814389  normal  0.972337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1443  hypothetical protein  66.33 
 
 		 98 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134283  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1513  hypothetical protein  65.66 
 
 		 99 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1869  hypothetical protein  66 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1697  hypothetical protein  64.65 
 
 		 98 aa  131  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3761  hypothetical protein  64.65 
 
 		 99 aa  130  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0166543  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24280  hypothetical protein  64.71 
 
 		 102 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14480  hypothetical protein  70.71 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350953  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13140  hypothetical protein  73.2 
 
 		 99 aa  126  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0412244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0875  hypothetical protein  58.16 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0365  hypothetical protein  53.06 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0756  hypothetical protein  57.14 
 
 		 100 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0354  hypothetical protein  53.06 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0375  hypothetical protein  53.06 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0458  hypothetical protein  56.7 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3581  hypothetical protein  53.61 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0702  hypothetical protein  53 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0306  hypothetical protein  51 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000000713456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0922  hypothetical protein  54.37 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5620  hypothetical protein  52.94 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00532761  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5163  hypothetical protein  58 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  0.0122988 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4597  hypothetical protein  47 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1354  hypothetical protein  59 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0240  hypothetical protein  44.9 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1898  hypothetical protein  43.88 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1758  hypothetical protein  44.9 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0167  hypothetical protein  44.9 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4179  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4437  hypothetical protein  39.8 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>