55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_16100  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  199  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.360035  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1411  hypothetical protein  89.8 
 
 
98 aa  185  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.594815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1935  hypothetical protein  88.89 
 
 
99 aa  181  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0431049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1701  hypothetical protein  88.89 
 
 
99 aa  181  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00523929  normal  0.166076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1924  hypothetical protein  85.86 
 
 
99 aa  180  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0297507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6771  hypothetical protein  79.8 
 
 
99 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2189  hypothetical protein  79 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.81414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2178  hypothetical protein  79 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847853  hitchhiker  0.00166357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2235  hypothetical protein  79 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685759  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15800  hypothetical protein  79.59 
 
 
98 aa  161  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.147759  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1555  hypothetical protein  79.8 
 
 
99 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3935  hypothetical protein  78 
 
 
100 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465243  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2465  hypothetical protein  78 
 
 
100 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.440907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1939  hypothetical protein  76.53 
 
 
99 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.965049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2883  hypothetical protein  73.47 
 
 
98 aa  155  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12714  hypothetical protein  76 
 
 
100 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392974  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2296  hypothetical protein  73.74 
 
 
99 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672941  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1404  hypothetical protein  72.73 
 
 
100 aa  153  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1634  hypothetical protein  74.23 
 
 
99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1443  hypothetical protein  74.49 
 
 
98 aa  150  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134283  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4064  hypothetical protein  74.76 
 
 
130 aa  148  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470832  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1513  hypothetical protein  72.73 
 
 
99 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2249  hypothetical protein  73.74 
 
 
99 aa  147  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1633  hypothetical protein  73.47 
 
 
97 aa  147  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1478  hypothetical protein  72.45 
 
 
98 aa  146  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0814389  normal  0.972337 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4596  hypothetical protein  72.55 
 
 
103 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1697  hypothetical protein  69.7 
 
 
98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4534  hypothetical protein  69.7 
 
 
99 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167065  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1882  hypothetical protein  71.72 
 
 
99 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2911  hypothetical protein  73.47 
 
 
96 aa  141  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1034  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24280  hypothetical protein  67.65 
 
 
102 aa  138  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3761  hypothetical protein  67.68 
 
 
99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0166543  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14480  hypothetical protein  69.7 
 
 
100 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350953  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1869  hypothetical protein  67 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13140  hypothetical protein  77.32 
 
 
99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0412244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0756  hypothetical protein  63.27 
 
 
100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0375  hypothetical protein  60.2 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0365  hypothetical protein  60.2 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0354  hypothetical protein  60.2 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113616  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0458  hypothetical protein  62.89 
 
 
99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0875  hypothetical protein  61.22 
 
 
100 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3581  hypothetical protein  59.79 
 
 
99 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0702  hypothetical protein  56 
 
 
97 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0306  hypothetical protein  55 
 
 
97 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000000713456  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4597  hypothetical protein  51 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1354  hypothetical protein  62 
 
 
97 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0922  hypothetical protein  52.94 
 
 
99 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5620  hypothetical protein  51.96 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00532761  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0240  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5163  hypothetical protein  59 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  0.0122988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0167  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1898  hypothetical protein  45.92 
 
 
100 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1758  hypothetical protein  48.98 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182199 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4179  hypothetical protein  48.98 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4437  hypothetical protein  44.9 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>