55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0702 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  6e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0306  hypothetical protein  87.63 
 
 		 97 aa  176  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000000713456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2296  hypothetical protein  57 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672941  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6771  hypothetical protein  57 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1935  hypothetical protein  59 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0431049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1701  hypothetical protein  57 
 
 		 99 aa  106  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00523929  normal  0.166076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2883  hypothetical protein  58.59 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16100  hypothetical protein  56 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.360035  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1939  hypothetical protein  58.59 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.965049  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4596  hypothetical protein  52.94 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1697  hypothetical protein  58 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395727  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1924  hypothetical protein  54 
 
 		 99 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0297507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1411  hypothetical protein  54.55 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.594815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4064  hypothetical protein  51.46 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470832  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1404  hypothetical protein  52 
 
 		 100 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1555  hypothetical protein  53 
 
 		 99 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15800  hypothetical protein  55.56 
 
 		 98 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.147759  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0756  hypothetical protein  53.54 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1513  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24280  hypothetical protein  51.46 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2235  hypothetical protein  51.49 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2189  hypothetical protein  51.49 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.81414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1869  hypothetical protein  52.48 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4534  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167065  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2178  hypothetical protein  51.49 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847853  hitchhiker  0.00166357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1443  hypothetical protein  51.52 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134283  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3935  hypothetical protein  51.49 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465243  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2465  hypothetical protein  51.49 
 
 		 100 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1634  hypothetical protein  51.02 
 
 		 99 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1478  hypothetical protein  51.52 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0814389  normal  0.972337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0875  hypothetical protein  51.52 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2249  hypothetical protein  51 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3761  hypothetical protein  52 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0166543  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0458  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12714  hypothetical protein  49.5 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1882  hypothetical protein  49 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3581  hypothetical protein  51.02 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2911  hypothetical protein  52 
 
 		 96 aa  91.3  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1633  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0365  hypothetical protein  47.96 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14480  hypothetical protein  51.49 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0354  hypothetical protein  47.96 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0375  hypothetical protein  47.96 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0922  hypothetical protein  44.12 
 
 		 99 aa  83.6  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5620  hypothetical protein  43.14 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00532761  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1354  hypothetical protein  45 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5163  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  0.0122988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13140  hypothetical protein  45.92 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0412244  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4597  hypothetical protein  45.54 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0167  hypothetical protein  45.45 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1758  hypothetical protein  43.43 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0240  hypothetical protein  43.43 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4179  hypothetical protein  40.82 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4437  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1898  hypothetical protein  41.41 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>