55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1354 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5163  hypothetical protein  91.75 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.87538  normal  0.0122988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0922  hypothetical protein  63.64 
 
 		 99 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5620  hypothetical protein  64.65 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00532761  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1633  hypothetical protein  66.33 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2189  hypothetical protein  62.38 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.81414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2178  hypothetical protein  62.38 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847853  hitchhiker  0.00166357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2235  hypothetical protein  62.38 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0685759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1404  hypothetical protein  66.34 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3935  hypothetical protein  61.39 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465243  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2465  hypothetical protein  61.39 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440907 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2883  hypothetical protein  62 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.543642 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1939  hypothetical protein  63 
 
 		 99 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.965049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16100  hypothetical protein  63.11 
 
 		 99 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.360035  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12714  hypothetical protein  60.4 
 
 		 100 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1411  hypothetical protein  63 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.594815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1935  hypothetical protein  63.11 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0431049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1697  hypothetical protein  62 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00395727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2249  hypothetical protein  59.22 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1701  hypothetical protein  61.17 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00523929  normal  0.166076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1924  hypothetical protein  60.19 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0297507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2296  hypothetical protein  59 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672941  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1882  hypothetical protein  57.28 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1513  hypothetical protein  55.56 
 
 		 99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6771  hypothetical protein  58.25 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1869  hypothetical protein  57 
 
 		 100 aa  106  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2911  hypothetical protein  58.76 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.1034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4534  hypothetical protein  58.42 
 
 		 99 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167065  normal  0.603625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3761  hypothetical protein  55.34 
 
 		 99 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0166543  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4064  hypothetical protein  58.65 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470832  normal  0.331608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24280  hypothetical protein  54.9 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0940368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1555  hypothetical protein  60.19 
 
 		 99 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4596  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15800  hypothetical protein  57 
 
 		 98 aa  100  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.147759  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1634  hypothetical protein  55.45 
 
 		 99 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1443  hypothetical protein  57 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134283  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0756  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.388421  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14480  hypothetical protein  55.77 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1478  hypothetical protein  55 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0814389  normal  0.972337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0365  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0354  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0375  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13140  hypothetical protein  55.1 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0412244  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0306  hypothetical protein  46 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000000713456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0875  hypothetical protein  52.53 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0702  hypothetical protein  45 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0458  hypothetical protein  52.94 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3581  hypothetical protein  48.04 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0167  hypothetical protein  46.46 
 
 		 100 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4597  hypothetical protein  43.56 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4179  hypothetical protein  43.88 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1758  hypothetical protein  45 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0240  hypothetical protein  41 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1898  hypothetical protein  39 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000002033 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4437  hypothetical protein  43.33 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>