54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0007 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00278469  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1685  tRNA-Pro  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.443459  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1763  tRNA-Pro  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2042  tRNA-Pro  93.59 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000171349  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1470  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2210  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000216222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2135  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00369966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0055  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.758534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0015  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000369215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0055  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0015  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000278716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0036  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000203357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0180  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0031  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.942258  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.226409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000933808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  89.58 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0563  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0297  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000682634  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0573  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0042  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0015  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0051  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0036  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000605853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0030  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.249196  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0040  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000750731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0049  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0408586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0046  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  84 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0080  tRNA-Pro  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0022  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0032  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0048  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0197037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>