8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0080 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0080  tRNA-Pro  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0036  tRNA-Pro  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000203357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0060  tRNA-Pro  89.58 
 
 
77 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000216222  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0025  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0007  tRNA-Pro  86 
 
 
78 bp  44.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00278469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>