15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0647 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0647  TraT complement resistance  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4306  TraT complement resistance family protein  45 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0180291 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0002  TraT complement resistance protein  43.97 
 
 
245 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0012  conjugal transfer surface exclusion protein TraT  45.2 
 
 
243 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0017  hypothetical protein  40.08 
 
 
248 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0792  TraT complement resistance family protein  41.94 
 
 
245 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0013  hypothetical protein  42.56 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.491025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0017  TraT complement resistance  36.64 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0956  TraT complement resistance  35.17 
 
 
248 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000913357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1313  complement resistance protein  42.86 
 
 
179 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0798  TraT complement resistance family protein  30.91 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000491779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0965  TraT complement resistance protein  33.33 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000396353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0297  hypothetical protein  25.95 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.415979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1329  TraT  54.55 
 
 
42 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3992  hypothetical protein  36.21 
 
 
105 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>