14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_C0002 on replicon NC_009787
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009787  EcE24377A_C0002  TraT complement resistance protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0012  conjugal transfer surface exclusion protein TraT  81.67 
 
 		 243 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4306  TraT complement resistance family protein  75.1 
 
 		 243 aa  362  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0180291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1313  complement resistance protein  75.98 
 
 		 179 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0013  hypothetical protein  43.93 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.491025  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0647  TraT complement resistance  44.36 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0017  hypothetical protein  41.77 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0792  TraT complement resistance family protein  38.96 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0017  TraT complement resistance  30.56 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0956  TraT complement resistance  29.52 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000913357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0965  TraT complement resistance protein  32.48 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000396353  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0798  TraT complement resistance family protein  33.33 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000491779  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0297  hypothetical protein  28.83 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.415979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1329  TraT  82.86 
 
 		 42 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>