14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0297 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0297  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.415979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0965  TraT complement resistance protein  71.37 
 
 
260 aa  298  6e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000396353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0792  TraT complement resistance family protein  30.48 
 
 
245 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0012  conjugal transfer surface exclusion protein TraT  29.46 
 
 
243 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0002  TraT complement resistance protein  29.2 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4306  TraT complement resistance family protein  28.31 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0180291 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0013  hypothetical protein  27.68 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.491025  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0017  hypothetical protein  27.31 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0647  TraT complement resistance  27.1 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0956  TraT complement resistance  27.2 
 
 
248 aa  72  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000913357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0017  TraT complement resistance  27.46 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0798  TraT complement resistance family protein  30.59 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000491779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1313  complement resistance protein  25.49 
 
 
179 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1496  hypothetical protein  28 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.463779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>