13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0017 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0017  TraT complement resistance  100 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0956  TraT complement resistance  78.92 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000913357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0792  TraT complement resistance family protein  36.69 
 
 		 245 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0012  conjugal transfer surface exclusion protein TraT  33.6 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4306  TraT complement resistance family protein  36.14 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0180291 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0647  TraT complement resistance  35 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0002  TraT complement resistance protein  30.95 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0013  hypothetical protein  34.89 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.491025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1313  complement resistance protein  36.09 
 
 		 179 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0798  TraT complement resistance family protein  24.51 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000491779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0965  TraT complement resistance protein  27.5 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000396353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0297  hypothetical protein  26.45 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.415979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>