14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0017 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0017  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0013  hypothetical protein  72.95 
 
 
248 aa  329  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.491025  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4306  TraT complement resistance family protein  46.84 
 
 
243 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0180291 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0002  TraT complement resistance protein  42.19 
 
 
245 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0012  conjugal transfer surface exclusion protein TraT  42.62 
 
 
243 aa  178  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0792  TraT complement resistance family protein  40 
 
 
245 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0647  TraT complement resistance  41.3 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1313  complement resistance protein  42.7 
 
 
179 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0956  TraT complement resistance  33.19 
 
 
248 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000913357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0017  TraT complement resistance  33.33 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0798  TraT complement resistance family protein  27.95 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000491779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0965  TraT complement resistance protein  31.03 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000396353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0297  hypothetical protein  25.93 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.415979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0302  hypothetical protein  29.9 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>