12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2020 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  706    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115091  normal  0.412427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2926  hypothetical protein  93.98 
 
 		 944 aa  624  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0026  hypothetical protein  79.88 
 
 		 940 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00859162  normal  0.584217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3406  hypothetical protein  50.15 
 
 		 893 aa  309  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2430  hypothetical protein  28.63 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357065  hitchhiker  0.0000115459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7990  hypothetical protein  28.57 
 
 		 755 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1556  hypothetical protein  25.7 
 
 		 830 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1278  hypothetical protein  27.01 
 
 		 812 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2408  hypothetical protein  26.07 
 
 		 763 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000507419  decreased coverage  0.000148317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0329  hypothetical protein  27.93 
 
 		 762 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1617  hypothetical protein  22.9 
 
 		 837 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4121  helix-turn-helix domain-containing protein  95 
 
 		 184 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>