27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3206 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3206  putative esterase  100 
 
 		 421 aa  875    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  32.66 
 
 		 366 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  23.47 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  23.24 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  27.17 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  21.62 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  25.51 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  19.33 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  24.01 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  28.66 
 
 		 288 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3719  putative esterase  25.1 
 
 		 285 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2064  alpha/beta fold family hydrolase  22.6 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  22.31 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  21.16 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  28.02 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  25.2 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  25 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3395  alpha/beta fold family hydrolase  21.97 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.981621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24.59 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  22.59 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  19.77 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  23 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3769  hypothetical protein  26.01 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  21.3 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  22.15 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0458  putative esterase  23.7 
 
 		 237 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4495  putative esterase  22.99 
 
 		 294 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>