43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3769 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3769  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  786    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4452  hypothetical protein  67.6 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4845  hypothetical protein  64.17 
 
 		 395 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4179  hypothetical protein  60.11 
 
 		 403 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3965  hypothetical protein  58.38 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  59.94 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0075  hypothetical protein  48.84 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0079  hypothetical protein  37.93 
 
 		 158 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  26.59 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  27.2 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  26.8 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  24.19 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  26.61 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  25.64 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  26.79 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  25.09 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  21.04 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  26.7 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  26.14 
 
 		 462 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  25.86 
 
 		 442 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  25.57 
 
 		 405 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  21.08 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  25.14 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  22.96 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  22.59 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  22.96 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  23.72 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  29.65 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  20.92 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  24.16 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  19.11 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  26.89 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  34.52 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3206  putative esterase  26.01 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  36.07 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  19.26 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2538  putative esterase  24.28 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  19.94 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  28.06 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  42.59 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.23 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  25.85 
 
 		 280 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>