93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2088 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  100 
 
 
366 aa  751    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3206  putative esterase  32.66 
 
 
421 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  32.33 
 
 
445 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  27.09 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  24.33 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  25.86 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  27.11 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  26.69 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3277  putative esterase  25.21 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.294344  normal  0.0259177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  31.51 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  31.48 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  29.63 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  26.8 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  25 
 
 
448 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  24.05 
 
 
388 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  29.68 
 
 
307 aa  63.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.17 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  29.61 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0471  putative esterase  28.49 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  26.37 
 
 
462 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  26.82 
 
 
442 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  24.16 
 
 
421 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3965  hypothetical protein  29.49 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  25.81 
 
 
400 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1478  putative esterase  30.81 
 
 
355 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500131  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  27.03 
 
 
280 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0603  hypothetical protein  30.41 
 
 
251 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0850733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1658  putative esterase  24.26 
 
 
430 aa  52.8  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4039  putative esterase  28.57 
 
 
314 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  25.95 
 
 
420 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4179  hypothetical protein  27.59 
 
 
403 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0083  putative esterase  25.96 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4845  hypothetical protein  28 
 
 
395 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4497  putative esterase  28.57 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4037  putative esterase  28.29 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.205002 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0723  putative esterase  28.83 
 
 
200 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.173587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4946  putative esterase  27.27 
 
 
295 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580943  normal  0.169227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  21.1 
 
 
291 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2656  putative esterase  31.94 
 
 
299 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1232  putative esterase  28.29 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.417705  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  30 
 
 
386 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1012  hypothetical protein  28.57 
 
 
252 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0439007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1031  hypothetical protein  28.57 
 
 
252 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2085  putative esterase  20.54 
 
 
423 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  26.29 
 
 
286 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3759  putative esterase  28.29 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5695  putative esterase  28.29 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712363 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4609  putative esterase  28.29 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.006335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3769  hypothetical protein  29.65 
 
 
383 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  27.54 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  26.81 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1701  hypothetical protein  27.43 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202768  normal  0.542752 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  26.81 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0458  putative esterase  26.09 
 
 
237 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  24.27 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  26.11 
 
 
708 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1411  putative esterase  30.27 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474659  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2741  putative esterase  27.63 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1112  putative esterase  28.03 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291043  normal  0.610364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4452  hypothetical protein  27.27 
 
 
394 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  26.09 
 
 
384 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1097  putative esterase  27.01 
 
 
295 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.808292 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  27.86 
 
 
386 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  27.88 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6228  putative esterase  26.45 
 
 
273 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.226912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  27.11 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1124  acetyl esterase  26.67 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  21.92 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  28.35 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2339  putative esterase  27.68 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.16 
 
 
640 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1150  hypothetical protein  26.67 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1131  acetyl esterase  26.67 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4870  putative esterase  25.41 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1242  hypothetical protein  26.67 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.211927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0882  putative esterase  27.63 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1310  hypothetical protein  26.67 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000227034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4060  hypothetical protein  25.33 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770329  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1284  hypothetical protein  26.67 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  25.57 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1387  hypothetical protein  26.63 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00153591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1349  hypothetical protein  26.63 
 
 
243 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1456  esterase, putative  26.97 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2504  putative esterase  27.78 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.807754  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3767  hypothetical protein  23.14 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2329  putative esterase  25.87 
 
 
268 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3502  putative esterase  23.48 
 
 
272 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0242  putative esterase  29.68 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  26.09 
 
 
351 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3745  hypothetical protein  21.49 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000059605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1341  putative esterase  25 
 
 
279 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4543  hypothetical protein  30.69 
 
 
308 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>