20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0816 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0816  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  303  8.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0982442  hitchhiker  0.0000295001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3763  hypothetical protein  72.41 
 
 		 145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.000438063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0778  hypothetical protein  65.03 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00149988  hitchhiker  0.00290825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3718  hypothetical protein  57.66 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000313462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3659  hypothetical protein  57.66 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.455862  hitchhiker  0.0000000693447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0787  hypothetical protein  57.66 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.223249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3841  hypothetical protein  57.66 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0018703  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0651  hypothetical protein  56.93 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429003  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3987  hypothetical protein  58.39 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0652  hypothetical protein  55.47 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.020046  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3370  hypothetical protein  55.47 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00382393  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0534  hypothetical protein  54.68 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0679  hypothetical protein  53.62 
 
 		 144 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0734  hypothetical protein  68.27 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0223559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0602  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.024256  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2983  hypothetical protein  48.92 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00935  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2310  hypothetical protein  36.56 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1946  hypothetical protein  31.5 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000222143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2367  hypothetical protein  34.18 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.9174  normal  0.289854 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>