19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0651 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0651  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429003  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0652  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.020046  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3370  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00382393  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3987  hypothetical protein  90.28 
 
 
144 aa  279  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0787  hypothetical protein  88.19 
 
 
144 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.223249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3659  hypothetical protein  88.19 
 
 
144 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.455862  hitchhiker  0.0000000693447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3841  hypothetical protein  87.5 
 
 
144 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0018703  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3718  hypothetical protein  87.5 
 
 
144 aa  266  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000313462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0679  hypothetical protein  83.33 
 
 
144 aa  254  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0534  hypothetical protein  53.47 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0778  hypothetical protein  57.34 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00149988  hitchhiker  0.00290825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3763  hypothetical protein  57.34 
 
 
145 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.000438063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0816  hypothetical protein  56.93 
 
 
145 aa  157  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0982442  hitchhiker  0.0000295001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0602  hypothetical protein  53.52 
 
 
163 aa  149  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.024256  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2983  hypothetical protein  51.05 
 
 
145 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0734  hypothetical protein  56.73 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0223559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2310  hypothetical protein  43.82 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00935  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1946  hypothetical protein  30.71 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000222143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>