19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0734 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0734  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0223559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3763  hypothetical protein  67.31 
 
 
145 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.000438063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0816  hypothetical protein  68.27 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0982442  hitchhiker  0.0000295001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0778  hypothetical protein  60.58 
 
 
143 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00149988  hitchhiker  0.00290825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0534  hypothetical protein  57.69 
 
 
147 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0651  hypothetical protein  56.73 
 
 
144 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429003  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0652  hypothetical protein  55.77 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.020046  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3370  hypothetical protein  55.77 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00382393  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0787  hypothetical protein  55.24 
 
 
144 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.223249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3659  hypothetical protein  55.24 
 
 
144 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.455862  hitchhiker  0.0000000693447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3841  hypothetical protein  55.24 
 
 
144 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0018703  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3718  hypothetical protein  55.24 
 
 
144 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000313462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3987  hypothetical protein  54.81 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0679  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0602  hypothetical protein  48.08 
 
 
163 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.024256  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2983  hypothetical protein  49.52 
 
 
145 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2310  hypothetical protein  40.48 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00935  hypothetical protein  30.61 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1946  hypothetical protein  32 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000222143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>