19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3763 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3763  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.000438063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0816  hypothetical protein  72.41 
 
 
145 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0982442  hitchhiker  0.0000295001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0778  hypothetical protein  60.14 
 
 
143 aa  183  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00149988  hitchhiker  0.00290825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0787  hypothetical protein  58.04 
 
 
144 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.223249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3659  hypothetical protein  58.04 
 
 
144 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.455862  hitchhiker  0.0000000693447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3841  hypothetical protein  58.04 
 
 
144 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0018703  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3718  hypothetical protein  57.34 
 
 
144 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000313462  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0651  hypothetical protein  57.34 
 
 
144 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429003  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3987  hypothetical protein  55.94 
 
 
144 aa  157  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0652  hypothetical protein  55.94 
 
 
144 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.020046  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3370  hypothetical protein  55.94 
 
 
144 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00382393  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0679  hypothetical protein  53.85 
 
 
144 aa  156  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0602  hypothetical protein  53.15 
 
 
163 aa  150  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.024256  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0734  hypothetical protein  67.31 
 
 
118 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0223559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0534  hypothetical protein  52.17 
 
 
147 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2983  hypothetical protein  50.34 
 
 
145 aa  136  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2310  hypothetical protein  39.33 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00935  hypothetical protein  29.69 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1946  hypothetical protein  33.05 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000222143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>