19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0679 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0679  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0787  hypothetical protein  90.97 
 
 		 144 aa  273  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.223249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3659  hypothetical protein  90.97 
 
 		 144 aa  273  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.455862  hitchhiker  0.0000000693447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3841  hypothetical protein  90.97 
 
 		 144 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0018703  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3718  hypothetical protein  90.28 
 
 		 144 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000313462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3987  hypothetical protein  84.03 
 
 		 144 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0651  hypothetical protein  83.33 
 
 		 144 aa  254  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000429003  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0652  hypothetical protein  81.94 
 
 		 144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.020046  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3370  hypothetical protein  81.94 
 
 		 144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00382393  hitchhiker  0.00694249 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0534  hypothetical protein  54.17 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0778  hypothetical protein  57.34 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00149988  hitchhiker  0.00290825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3763  hypothetical protein  53.85 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.000438063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0816  hypothetical protein  53.62 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0982442  hitchhiker  0.0000295001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0602  hypothetical protein  49.3 
 
 		 163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.024256  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2983  hypothetical protein  47.22 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0734  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0223559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2310  hypothetical protein  34.68 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1946  hypothetical protein  31.82 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000222143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00935  hypothetical protein  26.96 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>