28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0209 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0209  microcompartments protein  100 
 
 		 271 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2262  propanediol utilization protein PduB  72.16 
 
 		 270 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.124484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2375  propanediol utilization protein PduB  71.79 
 
 		 270 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2162  propanediol utilization protein PduB  72.16 
 
 		 270 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2209  propanediol utilization protein PduB  71.79 
 
 		 270 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.129626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2216  propanediol utilization protein PduB  71.79 
 
 		 270 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2280  propanediol utilization protein PduB  78.54 
 
 		 233 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.428567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1954  microcompartments protein  65.56 
 
 		 265 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1030  microcompartments protein  69.6 
 
 		 231 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0588796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1166  microcompartments protein  67.36 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.236068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0906  polyhedral shell protein, EutL/PduB type  69.43 
 
 		 280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.633495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4096  microcompartments protein  62.36 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1748  microcompartments protein  53.33 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1240  microcompartments protein  27.18 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.407797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2811  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2725  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2576  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2690  ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0908127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2649  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2716  ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.823551  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2601  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2823  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3669  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2594  putative ethanolamine utilization protein EutL  26.7 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1222  microcompartments protein  26.7 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1056  microcompartments protein  26.86 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1242  microcompartments protein  31.67 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2644  microcompartments protein  26.29 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>