28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1954 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1954  microcompartments protein  100 
 
 
265 aa  528  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0209  microcompartments protein  65.56 
 
 
271 aa  342  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1166  microcompartments protein  69.48 
 
 
249 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.236068  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2216  propanediol utilization protein PduB  73.18 
 
 
270 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1030  microcompartments protein  73.25 
 
 
231 aa  334  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0588796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2375  propanediol utilization protein PduB  73.18 
 
 
270 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2162  propanediol utilization protein PduB  73.18 
 
 
270 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2262  propanediol utilization protein PduB  73.18 
 
 
270 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.124484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2280  propanediol utilization protein PduB  72.27 
 
 
233 aa  332  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.428567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2209  propanediol utilization protein PduB  72.73 
 
 
270 aa  331  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.129626  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0906  polyhedral shell protein, EutL/PduB type  72.81 
 
 
280 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.633495  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4096  microcompartments protein  63.02 
 
 
261 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1748  microcompartments protein  58.53 
 
 
238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2725  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.67 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1240  microcompartments protein  27.67 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.407797  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2811  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.67 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2576  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.67 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02339  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanolamine utilization  27.67 
 
 
219 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02301  hypothetical protein  27.67 
 
 
219 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3669  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.67 
 
 
219 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1222  microcompartments protein  27.67 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2594  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 
219 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2690  ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 
219 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0908127  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2601  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 
219 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2823  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 
219 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2716  ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 
219 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.823551  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2649  putative ethanolamine utilization protein EutL  27.18 
 
 
219 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2644  microcompartments protein  24.57 
 
 
218 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>