33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2823 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2823  putative ethanolamine utilization protein EutL  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2601  putative ethanolamine utilization protein EutL  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2716  ethanolamine utilization protein EutL  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.823551  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2649  putative ethanolamine utilization protein EutL  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2690  ethanolamine utilization protein EutL  99.54 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0908127  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02339  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanolamine utilization  95.43 
 
 		 219 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02301  hypothetical protein  95.43 
 
 		 219 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3669  putative ethanolamine utilization protein EutL  94.98 
 
 		 219 aa  423  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2576  putative ethanolamine utilization protein EutL  95.89 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2811  putative ethanolamine utilization protein EutL  95.89 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2725  putative ethanolamine utilization protein EutL  95.89 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1240  microcompartments protein  95.89 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.407797  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1222  microcompartments protein  94.06 
 
 		 219 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2594  putative ethanolamine utilization protein EutL  95.43 
 
 		 219 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1242  microcompartments protein  57.87 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0893  ethanolamine utilization protein EutL  56.13 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1056  microcompartments protein  53.3 
 
 		 217 aa  231  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2644  microcompartments protein  53.05 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1298  microcompartments protein  50.94 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4864  microcompartments protein  51.4 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0072  microcompartments protein  54.25 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4032  microcompartments protein  53.46 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2262  propanediol utilization protein PduB  29.78 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.124484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2162  propanediol utilization protein PduB  29.78 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2375  propanediol utilization protein PduB  29.78 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2216  propanediol utilization protein PduB  29.78 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2209  propanediol utilization protein PduB  29.78 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.129626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2280  propanediol utilization protein PduB  28.72 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.428567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1954  microcompartments protein  27.18 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0906  polyhedral shell protein, EutL/PduB type  29.35 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.633495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0209  microcompartments protein  27.18 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1030  microcompartments protein  28.28 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0588796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1166  microcompartments protein  29.21 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.236068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>