31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1242 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1242  microcompartments protein  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1056  microcompartments protein  59.91 
 
 
217 aa  263  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0072  microcompartments protein  60.38 
 
 
217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1298  microcompartments protein  56.81 
 
 
217 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2823  putative ethanolamine utilization protein EutL  57.87 
 
 
219 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2601  putative ethanolamine utilization protein EutL  57.87 
 
 
219 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2716  ethanolamine utilization protein EutL  57.87 
 
 
219 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.823551  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2649  putative ethanolamine utilization protein EutL  57.87 
 
 
219 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2690  ethanolamine utilization protein EutL  57.87 
 
 
219 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0908127  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2644  microcompartments protein  56.13 
 
 
218 aa  248  7e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1222  microcompartments protein  56.94 
 
 
219 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2594  putative ethanolamine utilization protein EutL  56.94 
 
 
219 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1240  microcompartments protein  56.94 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.407797  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02339  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanolamine utilization  56.94 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02301  hypothetical protein  56.94 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3669  putative ethanolamine utilization protein EutL  56.94 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2576  putative ethanolamine utilization protein EutL  56.94 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2811  putative ethanolamine utilization protein EutL  56.94 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2725  putative ethanolamine utilization protein EutL  56.94 
 
 
219 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0893  ethanolamine utilization protein EutL  57.75 
 
 
217 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4864  microcompartments protein  58.1 
 
 
215 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4032  microcompartments protein  52.75 
 
 
218 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2262  propanediol utilization protein PduB  28.98 
 
 
270 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.124484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2162  propanediol utilization protein PduB  28.98 
 
 
270 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2375  propanediol utilization protein PduB  28.98 
 
 
270 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2216  propanediol utilization protein PduB  28.98 
 
 
270 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2280  propanediol utilization protein PduB  28.98 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.428567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2209  propanediol utilization protein PduB  28.98 
 
 
270 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.129626  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1030  microcompartments protein  27.62 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0588796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0906  polyhedral shell protein, EutL/PduB type  29.44 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.633495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0209  microcompartments protein  31.67 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>