30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0906 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0906  polyhedral shell protein, EutL/PduB type  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.633495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1166  microcompartments protein  91.13 
 
 		 249 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.236068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4096  microcompartments protein  69.64 
 
 		 261 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1954  microcompartments protein  62.14 
 
 		 265 aa  333  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0209  microcompartments protein  62.37 
 
 		 271 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2375  propanediol utilization protein PduB  60.43 
 
 		 270 aa  321  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2216  propanediol utilization protein PduB  60.43 
 
 		 270 aa  321  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2162  propanediol utilization protein PduB  60.07 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2262  propanediol utilization protein PduB  60.07 
 
 		 270 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.124484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1030  microcompartments protein  69.83 
 
 		 231 aa  319  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0588796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2209  propanediol utilization protein PduB  59.71 
 
 		 270 aa  318  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.129626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2280  propanediol utilization protein PduB  68.52 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.428567  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1748  microcompartments protein  53.05 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2811  putative ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1240  microcompartments protein  29.35 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.407797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2725  putative ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2576  putative ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2649  putative ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2716  ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.823551  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2690  ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0908127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2601  putative ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2823  putative ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3669  putative ethanolamine utilization protein EutL  29.35 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02339  predicted carboxysome structural protein with predicted role in ethanolamine utilization  28.86 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02301  hypothetical protein  28.86 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2594  putative ethanolamine utilization protein EutL  28.86 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1222  microcompartments protein  28.86 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1242  microcompartments protein  29.44 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0893  ethanolamine utilization protein EutL  28.06 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2644  microcompartments protein  28.09 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>