22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2602 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2602  putative lipoprotein  100 
 
 
80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2267  conserved hypothetical protein  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0028378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01350  hypothetical protein  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1465  putative lipoprotein  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.571018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1564  putative lipoprotein  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01362  hypothetical protein  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2277  hypothetical protein  45.68 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1690  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1507  putative cytoplasmic protein  40.74 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1829  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1769  putative cytoplasmic protein  40.74 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1766  putative cytoplasmic protein  40.74 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0575913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2135  putative cytoplasmic protein  43.21 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2295  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2595  protein of unknown function DUF333  34.94 
 
 
96 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1772  putative lipoprotein  43.59 
 
 
41 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1916  putative lipoprotein  34.69 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2001  putative lipoprotein  43.59 
 
 
41 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.999298 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2210  putative lipoprotein  34.78 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.780077  normal  0.269082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1806  putative lipoprotein  32.67 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1742  protein of unknown function DUF333  35.29 
 
 
94 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0221  hypothetical protein  43.9 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>