31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2210 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2210  putative lipoprotein  100 
 
 		 97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.780077  normal  0.269082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1916  putative lipoprotein  98.97 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1806  putative lipoprotein  94.17 
 
 		 136 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2267  conserved hypothetical protein  45.16 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0028378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01362  hypothetical protein  45.16 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2277  hypothetical protein  45.16 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1564  putative lipoprotein  45.16 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1465  putative lipoprotein  45.16 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.571018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01350  hypothetical protein  45.16 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1690  hypothetical protein  44.09 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1507  putative cytoplasmic protein  44.09 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1769  putative cytoplasmic protein  44.09 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1829  hypothetical protein  44.09 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2135  putative cytoplasmic protein  43.01 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1766  putative cytoplasmic protein  44.09 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0575913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2595  protein of unknown function DUF333  38.3 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2295  hypothetical protein  37.76 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1742  protein of unknown function DUF333  51.79 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1777  protein of unknown function DUF333  34.41 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2602  putative lipoprotein  51.16 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1772  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 41 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2001  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 41 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.999298 
 
 
-
 
NC_003296  RS03138  proline rich transmembrane protein  29.73 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.497108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0221  hypothetical protein  41.18 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5610  hypothetical protein  45.61 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  42.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4187  protein of unknown function DUF333  40.82 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4299  protein of unknown function DUF333  40.82 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0124  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2199  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2321  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>