22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01350 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2267  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0028378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01362  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1465  putative lipoprotein  100 
 
 		 88 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.571018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1564  putative lipoprotein  100 
 
 		 88 aa  174  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2277  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01350  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1690  hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1507  putative cytoplasmic protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1769  putative cytoplasmic protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1829  hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1766  putative cytoplasmic protein  90.91 
 
 		 88 aa  163  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0575913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2135  putative cytoplasmic protein  86.36 
 
 		 88 aa  158  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1772  putative lipoprotein  100 
 
 		 41 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2001  putative lipoprotein  100 
 
 		 41 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.999298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2595  protein of unknown function DUF333  45.26 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2295  hypothetical protein  45.16 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2602  putative lipoprotein  42.25 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1777  protein of unknown function DUF333  40.51 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1916  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2210  putative lipoprotein  45.16 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.780077  normal  0.269082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1806  putative lipoprotein  41.82 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1742  protein of unknown function DUF333  51.06 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>