22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1690 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1690  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1507  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1769  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1829  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1766  putative cytoplasmic protein  98.86 
 
 		 88 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0575913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2267  conserved hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0028378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01362  hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2277  hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1564  putative lipoprotein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1465  putative lipoprotein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.571018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01350  hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2135  putative cytoplasmic protein  88.64 
 
 		 88 aa  161  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1772  putative lipoprotein  92.68 
 
 		 41 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2001  putative lipoprotein  92.68 
 
 		 41 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.999298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2295  hypothetical protein  44.09 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2595  protein of unknown function DUF333  40.86 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1777  protein of unknown function DUF333  40.51 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1916  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2210  putative lipoprotein  44.09 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.780077  normal  0.269082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1742  protein of unknown function DUF333  51.02 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2602  putative lipoprotein  35.62 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1806  putative lipoprotein  47.22 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>