22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2001 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2267  conserved hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0028378  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01362  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1465  putative lipoprotein  100 
 
 
88 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.571018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1564  putative lipoprotein  100 
 
 
88 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2277  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01350  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2001  putative lipoprotein  100 
 
 
41 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.999298 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1772  putative lipoprotein  100 
 
 
41 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1690  hypothetical protein  92.68 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1507  putative cytoplasmic protein  92.68 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1769  putative cytoplasmic protein  92.68 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1829  hypothetical protein  92.68 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1766  putative cytoplasmic protein  90.24 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0575913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2135  putative cytoplasmic protein  85.37 
 
 
88 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2595  protein of unknown function DUF333  65.79 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2295  hypothetical protein  63.16 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1806  putative lipoprotein  55.56 
 
 
136 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1916  putative lipoprotein  55.56 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2210  putative lipoprotein  55.56 
 
 
97 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.780077  normal  0.269082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2602  putative lipoprotein  43.59 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1777  protein of unknown function DUF333  52.63 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1742  protein of unknown function DUF333  52.63 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>