More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0217 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0217  cell shape determining protein MreB/Mrl  100 
 
 
345 aa  679    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0636  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  65.1 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3652  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  62.39 
 
 
345 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.566148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.87 
 
 
337 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  45.48 
 
 
343 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.51 
 
 
339 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  44.78 
 
 
343 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  46.36 
 
 
344 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  45.4 
 
 
345 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  46.75 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  45.71 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  43.95 
 
 
343 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  44.28 
 
 
343 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  46.27 
 
 
333 aa  281  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  44.54 
 
 
340 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0471  rod shape-determining protein MreB  47.02 
 
 
330 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000843079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  44.88 
 
 
339 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  41.49 
 
 
368 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  41.07 
 
 
343 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  41.37 
 
 
343 aa  280  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3144  rod shape-determining protein Mbl  45.65 
 
 
344 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  43.37 
 
 
342 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  40.77 
 
 
343 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  43.36 
 
 
347 aa  278  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  45.2 
 
 
333 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  43.37 
 
 
342 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  43.54 
 
 
339 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.27 
 
 
344 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  42.03 
 
 
346 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1127  rod shape-determining protein MreB  44.71 
 
 
351 aa  276  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000227657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  40.47 
 
 
344 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  43.43 
 
 
342 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0260  rod shape-determining protein MreB  45.71 
 
 
330 aa  276  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0510  rod shape-determining protein MreB  44.38 
 
 
336 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  42.49 
 
 
344 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  44.38 
 
 
345 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  41.44 
 
 
350 aa  275  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  43.24 
 
 
342 aa  275  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  43.67 
 
 
345 aa  275  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1263  rod shape-determining protein MreB  44.14 
 
 
336 aa  275  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  42.49 
 
 
344 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  40.18 
 
 
343 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  43.4 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  42.77 
 
 
347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  44.29 
 
 
345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  40.29 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  44.27 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  42.77 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  42.53 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.21 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1630  rod shape-determining protein MreB  43.53 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  42.48 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  40.82 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  44.27 
 
 
333 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  41.59 
 
 
347 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  42.77 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  42.2 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.65 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  43.69 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0983  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 
336 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.408355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  42.94 
 
 
338 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  44.48 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0512  rod shape-determining protein MreB  43.49 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  42.18 
 
 
347 aa  272  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  42.18 
 
 
347 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  42.41 
 
 
347 aa  272  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  42.6 
 
 
344 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 
348 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  41.67 
 
 
344 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  42.65 
 
 
339 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  42.65 
 
 
339 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  42.65 
 
 
349 aa  271  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  42.6 
 
 
344 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  42.6 
 
 
344 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  43.73 
 
 
333 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  42.51 
 
 
343 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  41.77 
 
 
335 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  45.29 
 
 
340 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  43.73 
 
 
333 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  43.84 
 
 
336 aa  270  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  43.96 
 
 
333 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  42.06 
 
 
349 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  43.96 
 
 
333 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  42.18 
 
 
347 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  42.18 
 
 
347 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  44.27 
 
 
333 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>