14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5962 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  83.38 
 
 		 1176 bp  726    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5962    100 
 
 		 1150 bp  2280    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.650689  normal  0.599347 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6496    87.16 
 
 		 1169 bp  345  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.860001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5803    93.71 
 
 		 213 bp  212  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5426    86.09 
 
 		 804 bp  194  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0540337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  87.22 
 
 		 1275 bp  129  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  89.53 
 
 		 1113 bp  99.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0294  hypothetical protein  84.68 
 
 		 267 bp  77.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.74571 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  83.96 
 
 		 1269 bp  75.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1626    86.08 
 
 		 692 bp  61.9  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856906  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  86.15 
 
 		 1149 bp  58  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4193    90.7 
 
 		 1171 bp  54  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.872604  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4282    79.85 
 
 		 1205 bp  52  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  96.43 
 
 		 3045 bp  48.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>