14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4282 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4282    100 
 
 		 1205 bp  2389    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  88.27 
 
 		 1269 bp  1140    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0294  hypothetical protein  88.65 
 
 		 267 bp  153  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.74571 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  93.22 
 
 		 1173 bp  85.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  81.38 
 
 		 1176 bp  73.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  80.71 
 
 		 1113 bp  63.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4193    94.74 
 
 		 1171 bp  60  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.872604  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  89.36 
 
 		 1149 bp  54  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  83.54 
 
 		 1275 bp  54  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5962    79.85 
 
 		 1150 bp  52  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.650689  normal  0.599347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5426    93.75 
 
 		 804 bp  48.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0540337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6496    84.38 
 
 		 1169 bp  48.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.860001 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  87.5 
 
 		 1143 bp  48.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  93.75 
 
 		 2268 bp  48.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>