10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4193 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4193    100 
 
 		 1171 bp  2321    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.872604  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3773  integrase family protein  85.9 
 
 		 1173 bp  67.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  97.37 
 
 		 1149 bp  67.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4282    94.74 
 
 		 1205 bp  60  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  84.42 
 
 		 1143 bp  58  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5962    90.7 
 
 		 1150 bp  54  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.650689  normal  0.599347 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  88 
 
 		 1113 bp  52  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  93.94 
 
 		 1089 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1626    91.89 
 
 		 692 bp  50.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856906  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  80.36 
 
 		 1176 bp  48.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>