15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6496 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  87.82 
 
 		 1176 bp  1191    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6496    100 
 
 		 1169 bp  2317    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.860001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5962    87.16 
 
 		 1150 bp  345  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.650689  normal  0.599347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5803    90.57 
 
 		 213 bp  268  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.775258  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5426    85.78 
 
 		 804 bp  180  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0540337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1626    83.96 
 
 		 692 bp  113  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856906  normal  0.100388 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  83.63 
 
 		 1113 bp  101  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6311  integrase family protein  87.21 
 
 		 1143 bp  83.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.692197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8553  integrase family protein  95.35 
 
 		 1275 bp  69.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453986  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0294  hypothetical protein  81.97 
 
 		 267 bp  60  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.74571 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6161  integrase family protein  88.68 
 
 		 1149 bp  58  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5471  integrase family protein  87.5 
 
 		 1149 bp  56  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  90.48 
 
 		 1140 bp  52  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4282    84.38 
 
 		 1205 bp  48.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4516  phage integrase  79.84 
 
 		 1269 bp  48.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>