79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4647 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0502496  normal  0.0279353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4438  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  81.45 
 
 
128 aa  207  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  78.33 
 
 
136 aa  191  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2804  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.5 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2807  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.66 
 
 
194 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.64364  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2973  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.08 
 
 
141 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.196846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2722  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.84 
 
 
127 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2387  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.03 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3078  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.08 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2885  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.3 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.515742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3315  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.33 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3505  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.1 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218896  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
121 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2962  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.59 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.390569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3286  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.1 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2947  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2991  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 
329 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1430  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1785  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439636  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1871  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.185318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4775  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.8 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0481616  hitchhiker  0.00294019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4634  ring-cleaving dioxygenase  33.33 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4633  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.02 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52890  ring-cleaving dioxygenase  32.2 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908262  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0140  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  24.83 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4190  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2708  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.89 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144129  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  24.14 
 
 
173 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.385176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  27.66 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2484  hypothetical protein  23.88 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0198632  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5258  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1507  hypothetical protein  30.5 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4015  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2910  lactoylglutathione lyase, glyoxylase family protein  25 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742613  hitchhiker  0.00144174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal  0.0812359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4667  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1946  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.38 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3345  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
127 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0601  putative glyoxalase  31.75 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3208  glyoxylase family protein  25 
 
 
130 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  27.97 
 
 
150 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1957  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.343922  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2107  glyoxalase family protein  31.75 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.390472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3613  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
144 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2194  glyoxalase family protein  31.75 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0375114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.1 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5729  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.43 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.574413  normal  0.799624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2983  glyoxylase family protein  24.17 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1562  hypothetical protein  31.75 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.317926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1790  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.6 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066223  normal  0.274565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3373  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4319  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.18 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.363116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.32 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2042  hypothetical protein  31.75 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546279  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0721  hypothetical protein  31.75 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5811  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.485195  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0033  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118632 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0853  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.79 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000162872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4457  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225203  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1993  putative glyoxalase/dioxygenase  29.91 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3271  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.19 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0360  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  28.36 
 
 
156 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0046  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 
129 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>