53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1993 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1993  putative glyoxalase/dioxygenase  100 
 
 
113 aa  220  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251415  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.09 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448031  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1411  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.36 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2698  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.14 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5896  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.59 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4057  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1860  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.81 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.48 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2577  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1398  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0892  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.17 
 
 
123 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500555  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3041  putative lyase  30.95 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467192  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4772  putative glyoxalase/dioxygenase  32.08 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0119  glyoxalase family protein  30.91 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2482  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.03 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0655  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.64 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2500  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2217  hypothetical protein  31.97 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2176  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.55662  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6337  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0420  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.73 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260618  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1285  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0853  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000162872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225203  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0307  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.23 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2152  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 
277 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00497533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3058  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4061  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.2 
 
 
126 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015082 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5508  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.252641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2708  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.144129  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2898  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.523677  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4406  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8842  glyoxalase family protein  33.33 
 
 
118 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.141871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 
136 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
136 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00157513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3328  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.09 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3246  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
117 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1329  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
125 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4667  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.59 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0733  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.18 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375347  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 
329 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8805  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3627  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1285  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  hitchhiker  0.00110448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5951  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.18 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2987  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.91 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0502496  normal  0.0279353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0290  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0505928  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2804  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 
133 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
136 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00159015  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4070  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.69 
 
 
145 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>