234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3920 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3920  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
349 aa  713    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1915  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  54.68 
 
 
371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2899  fructose-1,6-bisphosphatase  55.99 
 
 
344 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0650295 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4046  fructose-1,6-bisphosphatase  54.82 
 
 
345 aa  348  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0947  fructose-1,6-bisphosphatase  52.55 
 
 
343 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3754  fructose-1,6-bisphosphatase  55.73 
 
 
345 aa  345  8e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.751748  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2715  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50.45 
 
 
333 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2694  fructose-1,6-bisphosphatase  53.92 
 
 
345 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0422248  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0445  D-fructose 1,6-bisphosphatase  53.18 
 
 
338 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2944  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50.15 
 
 
333 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1285  D-fructose 1,6-bisphosphatase  50.15 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5126  fructose-1,6-bisphosphatase  50.64 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1191  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.62 
 
 
352 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0640558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6401  D-fructose 1,6-bisphosphatase  53.45 
 
 
347 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1695  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50.59 
 
 
330 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.23091  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1050  fructose-1,6-bisphosphatase  51.15 
 
 
345 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3266  D-fructose 1,6-bisphosphatase  51.82 
 
 
331 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3999  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  51.82 
 
 
331 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218772  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0919  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  51.11 
 
 
348 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.547714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0943  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  51.11 
 
 
348 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0979  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  51.11 
 
 
348 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  48.57 
 
 
358 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3528  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  46.63 
 
 
329 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4015  hypothetical protein  50.3 
 
 
331 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  47.01 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  47.01 
 
 
338 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  49.02 
 
 
335 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  46.99 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  48.69 
 
 
335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  0.00000000837949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  48.23 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3559  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.56 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  46.33 
 
 
336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  46.33 
 
 
336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  47.04 
 
 
337 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  47.43 
 
 
335 aa  305  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  46.08 
 
 
338 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  46.84 
 
 
357 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  46.45 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  46.33 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  46.15 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  46.04 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  47.6 
 
 
336 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  45.73 
 
 
335 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  48.63 
 
 
338 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.53 
 
 
365 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422669  decreased coverage  0.0000800022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.28 
 
 
337 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  46.04 
 
 
336 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  48.35 
 
 
338 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  44.18 
 
 
336 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  48.05 
 
 
338 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  46.87 
 
 
335 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45.4 
 
 
364 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  44.19 
 
 
357 aa  295  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  45.12 
 
 
334 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  48.05 
 
 
338 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  47.13 
 
 
339 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  44.71 
 
 
337 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  47.13 
 
 
339 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  45.73 
 
 
341 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  47.42 
 
 
337 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3283  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.8 
 
 
343 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45.81 
 
 
338 aa  293  4e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  45.21 
 
 
339 aa  292  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  45.12 
 
 
336 aa  292  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  44.87 
 
 
336 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  45.13 
 
 
336 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  45.21 
 
 
339 aa  292  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  47.11 
 
 
337 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  47.11 
 
 
337 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45 
 
 
364 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0020  fructose-1,6-bisphosphatase  46.39 
 
 
338 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  47.11 
 
 
337 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  46.5 
 
 
337 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  44.51 
 
 
335 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  45.13 
 
 
365 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  46.79 
 
 
334 aa  290  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000101477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3589  D-fructose 1,6-bisphosphatase  50 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0270544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0821  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50 
 
 
355 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103187  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1187  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.44 
 
 
339 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  46.01 
 
 
335 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  42.77 
 
 
335 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1495  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  43.59 
 
 
337 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000616027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  43.98 
 
 
333 aa  276  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  44.54 
 
 
378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
369 aa  272  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0586  D-fructose 1,6-bisphosphatase  46.06 
 
 
331 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000325166  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0599  fructose-1,6-bisphosphatase  45.66 
 
 
320 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000176806  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  48.52 
 
 
322 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  42.3 
 
 
339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  42.3 
 
 
339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  43 
 
 
325 aa  269  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  45.14 
 
 
323 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>