236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0979 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0919  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  93.68 
 
 
348 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.547714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0943  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  99.43 
 
 
348 aa  704    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0979  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  100 
 
 
348 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3559  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  67.15 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2899  fructose-1,6-bisphosphatase  53.42 
 
 
344 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0650295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3754  fructose-1,6-bisphosphatase  51.03 
 
 
345 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.751748  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3920  fructose-1,6-bisphosphatase  49.57 
 
 
349 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2694  fructose-1,6-bisphosphatase  51.9 
 
 
345 aa  332  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0422248  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5126  fructose-1,6-bisphosphatase  49.27 
 
 
343 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4046  fructose-1,6-bisphosphatase  52.41 
 
 
345 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1191  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  51.55 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0640558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2715  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  51.69 
 
 
333 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0947  fructose-1,6-bisphosphatase  50.48 
 
 
343 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1285  D-fructose 1,6-bisphosphatase  53.16 
 
 
333 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1915  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.62 
 
 
371 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2944  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  53.16 
 
 
333 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1695  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  52.66 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.23091  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1050  fructose-1,6-bisphosphatase  53.02 
 
 
345 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4015  hypothetical protein  51.52 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6401  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.28 
 
 
347 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3266  D-fructose 1,6-bisphosphatase  50 
 
 
331 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0445  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.41 
 
 
338 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3999  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  49.69 
 
 
331 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218772  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3528  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  49.18 
 
 
329 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  47.73 
 
 
336 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0319  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.17 
 
 
330 aa  288  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0821  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  48.98 
 
 
355 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  46.23 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2282  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.89 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0351631  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.04 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  44.07 
 
 
335 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  46.06 
 
 
338 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  46.45 
 
 
338 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  44.83 
 
 
325 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  45.28 
 
 
335 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  47.3 
 
 
323 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  45.78 
 
 
335 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  47.37 
 
 
339 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  44.59 
 
 
335 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  0.00000000837949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  47.04 
 
 
338 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.53 
 
 
357 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  44.52 
 
 
339 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  46.13 
 
 
338 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  44.52 
 
 
339 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  43.81 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  43.81 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  45.4 
 
 
341 aa  272  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  45.21 
 
 
334 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  45.25 
 
 
337 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  45.28 
 
 
335 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
338 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3991  fructose-1,6-bisphosphatase  44.04 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  45.05 
 
 
338 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3844  fructose-1,6-bisphosphatase  43.61 
 
 
325 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0810382  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  43.93 
 
 
336 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0773  fructose-1,6-bisphosphatase  42.68 
 
 
329 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0106002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  43.13 
 
 
364 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  43.42 
 
 
364 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  42.42 
 
 
337 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  45.63 
 
 
338 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  45.48 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  41.82 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  45.63 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  41.42 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  45.37 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  46.18 
 
 
334 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000101477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  41.82 
 
 
336 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3663  fructose-1,6-bisphosphatase  45.48 
 
 
325 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0199188  hitchhiker  0.00000825139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  41.82 
 
 
336 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  43.97 
 
 
358 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0586  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.94 
 
 
331 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000325166  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0649  fructose-1,6-bisphosphatase  43.3 
 
 
330 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000012106  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  43.71 
 
 
357 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3373  fructose-1,6-bisphosphatase  43.3 
 
 
330 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000187487  hitchhiker  0.00208925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  43.2 
 
 
335 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0784  fructose-1,6-bisphosphatase  42.99 
 
 
342 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  45.98 
 
 
333 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  45.16 
 
 
337 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  45.16 
 
 
337 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  46.56 
 
 
338 aa  265  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  41.82 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0676  fructose-1,6-bisphosphatase  42.99 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000449089  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3721  fructose-1,6-bisphosphatase  45.15 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  42.12 
 
 
336 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  44.98 
 
 
338 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  42.86 
 
 
337 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  44.73 
 
 
337 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0731  fructose-1,6-bisphosphatase  44.82 
 
 
329 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000293174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0648  fructose-1,6-bisphosphatase  43.3 
 
 
330 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000605795  hitchhiker  0.00000605277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  41.82 
 
 
336 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0599  fructose-1,6-bisphosphatase  44.08 
 
 
320 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000176806  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  44.98 
 
 
339 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  45.54 
 
 
322 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45.36 
 
 
335 aa  263  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>